Oligo-Primer-Probe

Pacificlab hiện là một trong những đơn vị uy tín tại Việt Nam trong việc cung cấp hóa chất sinh học phân tử chất lượng cao, đặc biệt là các sản phẩm oligo, primer và probe chính hãng từ Eurogentec – thương hiệu nổi tiếng toàn cầu.

Oligo Primer Probe Eurogentec - Đa dạng, ổn định và tinh khiết

Khung xương (Backbones)

Chúng tôi cung cấp oligos dựa trên khung xương truyền thống của các phân tử DNA và RNA, ngoài ra chúng tôi cũng cung cấp các bộ khung được chỉnh sửa theo nhu cầu của khách hàng. 
- Bộ khung có các nu gắn LNA® giúp tăng ái lực và độ đặc hiệu của oligo. Việc chỉnh sửa này giúp cấu trúc của chúng có độ ổn định cao với nhiệt, phù hợp cho các kỹ thuật lai đòi hỏi độ đặc hiệu và độ tái lặp cao. 
- Cả bộ khung RNA 2’-O-Me và liên kết phosphorothioate đều giúp tăng ái lực và độ đặc hiệu với khuôn mục tiêu, đồng thời tăng khả năng kháng nuclease. 
- Chúng tôi cũng cung cấp bộ khung PNA, rất phù hợp cho các nghiên cứu FISH. Loại DNA/RNA nhân tạo này mang lại độ đặc hiệu và độ nhạy cao hơn cho oligo, đồng thời có thể chống lại sự phân hủy bởi enzyme và giúp ổn định trong dung dịch có biến động về pH, nhiệt độ và nồng độ muối.

Các biến đổi (Modifications)

Ngoài các biển đổi của bộ khung, chúng tôi cũng cung cấp nhiều loại biến đổi bổ sung khác giúp mang lại đặc tính đặc biệt cho oligo. Ví dụ:
- Khả năng xuyên màng tế bào có thể đạt được bằng cách gắn cholesterol vào oligo, 
- Trong khi tăng ái lực và độ đặc hiệu có thể thực hiện với các base pyrimidine deoxy-nucleoside methyl hóa ở vị trí C-5, RNA 2’-fluoro hoặc methyl-dC, cùng các lựa chọn khác. 
Oligonucleotide có thể được biến đổi bằng cách tích hợp trực tiếp trong quá trình tổng hợp hoặc thực hiện sau khi tổng hợp.
•    Tích hợp trực tiếp: Quá trình tổng hợp oligo diễn ra từ đầu 3’ đến 5’, vì vậy việc tích hợp trực tiếp ở đầu 3’ không phải lúc nào cũng khả thi, tùy thuộc vào giá đỡ rắn và sự tương thích với các chất hóa học được sử dụng. Các biến đổi ở đầu 5’ và bên trong có thể được thêm vào bằng phosphoramidite, nhưng cần chịu được điều kiện cắt khắc nghiệt.
•    Tích hợp sau tổng hợp: Dùng để đưa vào các thuốc nhuộm hoặc hợp chất nhạy cảm không tồn tại ở dạng phosphoramidite. Cách này có thể ảnh hưởng đến hiệu suất phản ứng, đặc biệt khi có nhiều biến đổi hoặc cấu trúc bậc hai mạnh. Tất cả các biến đổi đều có sẵn ở cấp độ nghiên cứu, chẩn đoán và điều trị.

Tinh sạch (Purifications)

Chúng tôi có cung cấp nhiều lựa chọn tinh sạch cho từng nhu cầu, việc lựa chọn phương pháp tinh sạch cần dựa trên nhiều yếu tố như: chiều dài oligo, sự hiện diện và số lượng biến đổi, ứng dụng dự kiến và hiệu suất mong đợi.

Kiểm soát chất lượng (Quality Controls)

Kiểm soát chất lượng (QC) là bước then chốt trong quy trình sản xuất oligonucleotide. Tất cả các máy tổng hợp của chúng tôi đều được trang bị hệ thống giám sát theo thời gian thực để đảm bảo mỗi oligo sau khi tổng hợp sẽ đạt tiêu chuẩn chất lượng. Ngoài phép đo mật độ quang học thường quy (OD260) để đảm bảo lượng oligo chính xác, chúng tôi còn thực hiện nhiều kiểm tra QC tự động khác, được điều chỉnh theo loại và thông số kỹ thuật của từng oligo để đảm bảo hiệu suất và chất lượng tối ưu cho ứng dụng cụ thể của bạn. Các kiểm tra bổ sung có thể được thực hiện nếu cần.

Định dạng (Formats)

Theo yêu cầu của bạn, oligonucleotide có thể được cung cấp ở nhiều định dạng khác nhau. Dạng đông khô (dried) là định dạng mặc định (trừ các oligo chưa biến đổi SePoP từ 15 đến 39 base). Ngoài ra còn có: 
•    Dạng dung dịch: Có thể chọn loại dung dịch hoàn nguyên (H₂O hoặc TE pH=8), xác định thể tích (từ 50 đến 1000 μl) và/hoặc nồng độ oligo cuối cùng (từ 5 đến 250 μM).
•    Dạng ủ bắt cặp (Annealed): Oligo được xử lý nhanh bằng cách ủ ở 94°C rồi làm nguội dần đến nhiệt độ phòng. siRNA hoặc linker cho nhân dòng được ủ mặc định.
•    Dạng hỗn hợp (Mixed): Nhiều loại oligo khác nhau có thể được phối hợp với lượng tương đương trong một ống.

Đóng gói (Packaging)

Chúng tôi cung cấp nhiều lựa chọn đóng gói:
•    Ống 2 mL: Mặc định, mỗi oligo được đựng riêng trong ống 2 mL. Có thể yêu cầu thể tích lớn hơn (15 mL, 50 mL*).
•    Đĩa 96 giếng: Gồm ống theo strip, đĩa 96 loại thường và đĩa sâu, áp dụng cho oligo dài tối đa 59 base.
•    Chia aliquot: Tất cả oligo ở dạng dung dịch có thể được chia thành các aliquot nhỏ chính xác thể tích (50–1000 μl). Chúng tôi cũng cung cấp đóng gói tùy chỉnh theo yêu cầu dự án.

Các sản phẩm Oligo-primer-probe đặc trưng

Đầu dò Double-Dye

Đầu dò Double-Dye được gắn thuốc nhuộm huỳnh quang ở đầu 5’ và quencher ở đầu 3’. Có sẵn với các lựa chọn bộ khung xương DNA cổ điển, LNA® hoặc MGB để tăng ổn định nhiệt, độ đặc hiệu và khả năng tái lập. Chúng tôi có nhiều kết hợp thuốc nhuộm/quencher như FAM/BHQ®-1, ROX/BHQ®-2, HEX/MGB-EDQ, ATTO/BHQ®.

Đầu dò MGB

Đầu dò MGB là đầu dò gắn kép, có thêm Minor Groove Binder ở đầu 3’. MGB Eclipse® probe đặt tại Eurogentec không bị giới hạn bản quyền, dùng cho mọi ứng dụng trên thế giới. Danh mục thuốc nhuộm huỳnh quang của chúng tôi cho MGB Eclipse® probe bao phủ tất cả các kênh qPCR, giúp tăng độ đặc hiệu, độ nhạy và hiệu quả phân tích.

RNAi Oligos

RNA Interference (RNAi) là cơ chế ức chế gene ở mức sau phiên mã, gồm các phân tử RNA như siRNA và miRNA.
•    siRNA: Các siRNA tổng hợp được đưa vào tế bào để gây can thiệp RNA và ức chế biểu hiện mRNA cụ thể. SiRNA điển hình dài 21 base, gồm lõi 19 base RNA kép, nối tiếp bởi 2 nucleotide DNA đơn (thường là Thymidine) ở đầu 3’. Có nhiều tùy chọn tinh sạch như SePOP desalting, HPLC (RP hoặc IEX) hoặc quy trình tinh sạch in vivo-like.
•    Đối chứng siRNA: Cung cấp cả đối chứng dương và âm, đều tinh sạch bằng IEX-HPLC và kiểm tra bằng MALDI-TOF 100%. Đối chứng dương: nhắm vào các gene nội sinh hoặc gene report. Đối chứng âm: không có tương đồng với bất kỳ sinh vật nhân thực nào đã biết.

NGS Oligos

Eurogentec cung cấp oligo đạt chuẩn NGS, được sản xuất với quy trình đặc biệt để giảm nhiễm chéo ≤ 0,1%, giúp tránh sai lệch mã vạch trong các dự án NGS multiplex. Công nghệ NGS yêu cầu các trình tự adapter gắn vào DNA phân mảnh có độ tinh khiết cao và mức nhiễm chéo cực thấp.

Aptamer

Eurogentec hợp tác với Novaptech – đơn vị hàng đầu thế giới về phát triển aptamer oligonucleotide. Novaptech thực hiện tìm kiếm và tối ưu ứng viên aptamer, còn Eurogentec tổng hợp aptamer cuối cùng và các oligo cần cho quá trình phát triển. Aptamer là các oligonucleotide gắn đặc hiệu với phân tử đích dựa trên cấu trúc bậc ba, được coi là giải pháp thay thế kháng thể. Chúng tôi cung cấp aptamer RNA và DNA tùy chỉnh cho mục đích phân tích, chẩn đoán và điều trị, với nhiều định lượng và định dạng (chưa biến đổi hoặc đã biến đổi).

Hóa chất và Oligo trong danh mục (Catalog Reagents & Oligos)

Chúng tôi cung cấp hóa chất tổng hợp oligo từ Glen Research và các trình tự acid nucleic sẵn sàng sử dụng.

• Oligo danh mục: Ngoài dịch vụ tổng hợp tùy chỉnh, chúng tôi còn cung cấp các primer phổ dụng trong danh mục – là các primer đã thiết kế sẵn, bổ sung với các trình tự phổ biến ở nhiều phân tử DNA hoặc vector nhân dòng.
• Oligo hiệu chuẩn gắn thuốc nhuộm: Dùng để hiệu chuẩn máy qPCR thời gian thực.
• Đầu dò PNA-FISH: Phục vụ lai tại chỗ, và đối chứng siRNA âm/dương.